La Biblioteca especializada del Instituto Nacional de Biodiversidad recopila, preserva y difunde los diversos materiales bibliográficos impresos y en otros soportes, relacionados con la biología, fauna, flora del Ecuador y el mundo, taxonomía, ciencias de la tierra, etc.  En la actualidad la Biblioteca cuenta con una actualizada colección de libros, revistas científicas y separatas especializadas disponibles al usuario de lunes a viernes de 8:00 a 17:00 horas.